Вероятность сбоя на выходе синхронизатора мультипликативна - при добавлении в синхронизатор дополнительного триггера, она умножается на вероятность сбоя этого триггера. Судя по формулам, вероятность сбоя при удвоенной частоте на входе и 4х триггерах такая же, как при ординарной частоте входного сигнала и двух триггерах в синхронизаторе. Об этом кстати явно написано в статье по ссылке выше.

Есть достаточно надежный способ полностью избежать проблем при синхронизации, но требуется простейший TA (время-амплитуда) конвертер или иной способ оценки коротких интервалов времени. Делается два синхронизатора - один по положительному фронту одного из сигналов, другой - по отрицательному. Один из них всегда даст надежный отсчет, важно лишь определить - какой. Это делается измерением времени между фронтами (TA конвертер) и выбором того канала, задержка которого ближе к правде.

Это проверено, сбои исчезли полностью.