Из примера CDC Atmel сделал обработку USB запросов по прерываниям.
Основная программа пока "моргает" светодиодом, а обработка запросов по прерываниям.
Устройство успешно конфигурируется и драйвера ставятся но не "моргает"

Я предположил, что какое-то не обрабатываемое прерывание от USB мешает
поставил проверку и сброс по одиночке и выловил влияние флага AT91C_UDP_RXRSM:
Вот эта строка в обработчике прерывания от USB приводит к тому. что прерывания перестают вырабатываться.

if (ulIrqStatus & AT91C_UDP_RXRSM ) AT91C_BASE_UDP->UDP_ICR =AT91C_UDP_RXRSM ;


Покопал глубже.
В начале очищаю признаки прерываний:

AT91C_BASE_UDP->UDP_ICR = 0xFFFFFFFF;
tmp=AT91C_BASE_UDP->UDP_ISR;

Считывается 0 - то есть очищается
Затем сбрасываю в 0 и запрещаю адрес:

AT91C_BASE_UDP->UDP_FADDR=0;
tmp=AT91C_BASE_UDP->UDP_FADDR;

Считывается 0x0100.
То есть USB функция не запрещается - не понятно почему?

AT91C_BASE_UDP->UDP_GLBSTATE=0;
tmp=AT91C_BASE_UDP->UDP_GLBSTATE;


Запрещаю все прерывания:

AT91C_BASE_UDP->UDP_IDR = 0xFFFFFFFF;
tmp=AT91C_BASE_UDP->UDP_IMR;


Считывается 0x1200.

В IMR бит 12 не описан но судя по ISR - это бит прерывания по окончанию сброса шины USB.

Бит 9 это как раз злополучный RXRSM который не сбрасывается.

Это не правильная последовательность инициализации или ошибки кристалла?