Цитата
Возможен захват тактовой с отстройкой n*(1/T) от истинного значение частоты. Как модифицировать систему тактовой синхронизации, что бы не было такой беды?
Кратные захваты в данном случае не являются следствием "прерывистости" передачи, а обусловлены свойствами используемой системы синхронизации. Устранить захват кратных частот можно введя в цепь обратной связи ограничитель (перед перестраиваемым генератором), тем самым ограничив полосу удержания.
И еще, если используется именно система с обратной связью, желательно на время паузы блокировать вычисление сигнала ошибки, ибо полезной информации он не содержит, во-первых не будет петлю колбасить, во-вторых уменьшится время входа в синхронизм в начале следующего пакета.
И вообще при пакетной передаче лучше использовать систему тактовой синхронизации без ОС.