Cyclone и Cyclone II все проходило на "ура".
Cyclone III EP3C5E144 - полный ступор.
Линии JTAG ведут себя более чем странно, несмотря на подтяжку к VCCA (2.5V) утянуты в 0.
При подключении к ByteBlaster-MV (тоже запитан от VCCA (2.5V)) сигналы на входах есть, а
на TDO всегда 0, ну и соответственно программатор мс не видит.
MSEL = 101 (к VCCA).
Что недопонял, упустил, не дочитал?