Кратко как было в MS-DOS:
В MS-DOS для запуска надо было всего несколько файлов, IO.SYS, MSDOS.SYS и command.com обычно эти файлы переносились командой с загрузочной дискеты "SYS C:" (C - диск с которого потом будет стартовать дос), после чего эти файлы попадали в нужные сектора на диске, в которые BIOS передавал управление после своей работы. Драйвера прописываются в CONFIG.SYS, и уже последним command.com выполняет файл AUTOEXEC.BAT.

P.S. Если до команды SYS C:, диск был уже с файлами и отформатирован без резервирования места под системные файлы то загрузка с этого диска не произойдет.

Да, но не надо забывать, что это DR-DOS а не MS-DOS. В Window и приложениях к нему полно средств для создания загрузочной дискеты MS-DOS.
В том же Total Commander надо щелкнуть правой кнопкой на диске а и выбрать 'форматировать" ну и поставить галку "сделать загрузочной"
А как быть с DR-DOS?

Можно проще, загружаетесь с дискетки DR-DOS и даете команду "format c: /s" (обычно этот ключ все досы поддерживали) которая отформатирует диск С и запишет на него системные файлы (в то место на диске где они должны лежать).

Именно так я и делал

Ура! Мы наконец победили Agiecut220.
Многочасовые стояния у станка в течении более чем 2-х месяцев не пропали даром.
Огромное спасибо manul78 (Андрею), который подсказал верное направление и поделился очень важными файлами.
Если бы не его помощь, у нас вряд ли бы что-нибудь получилось.

Не стоит благодарностей. Настоящие технари, живущие своей профессией, ВСЕГДА помогают друг-другу. Пусть это будет хорошим примером для молодёжи.