Есть источник питания 27В 65Вт типа Meanwell PS65-27. Из этого источника нужно получить регулируемое напряжение от 2до 35В для питания электродвигателя с регулируемой скоростью вращения. Сопротивление обмотки 5 ом. Соответственно максимальную нагрузку можно снять при 18 вольтах на выходе. До 18вольт рост тока ограничивается сопротивлением обмотки.. Выше 18 вольт- мощностью источника питания. максимальный ток через движок получается 3.6Ампер. Спецмикросхемы нет, есть микропроцессор. Вопросы
1. какую топологию лучше использовать?
2. Я присмотрел SEPIC, какие возможны трудности?

Хм... Электродвигатель - вовсе на 5 Ом его обмотки в статике. Это режим заторможенного якоря.
Диапазон в 17 раз получить достаточно сложно. Это Вы на практике увидите.
SEPIC - на первый взгляд - самая подходящая топология. Трудности возникнут в режиме повышения входного напряжения (27 в 36). Некоторые трудности с устойчивостью петли ОС. Может, не нужно более 25-27В на движок подавать?
Мощность - ватт на 45-50 рассчитывайте, максимум. Этому нужно уделить внимание, потому что МИНВЕЛЛ PS65 будет выбивать при перегрузках или резких набросах нагрузки. Увидите, что при резистивной нагрузке источник как источник, а с двигателем выход гуляет по напряжению. Источник часто входит в режим ограничения мощности.

А будет ли при 2х вольтах двигатель работать???
Не лучше ли оперировать оборотами на валу,
т.е. регулировать обороты.

До 27В двигатель нормально регулируется понижающим регулятором от 2 до 27В, с примерным поддержанием оборотов с обратной связью по току и напряжению, от того же МИНВЕЛЛ PS65. С отдачей до 90% мощности. От 2х вольт. Это пройденный этап. Оборотов не хватает в некоторых случаев.
Следующий ряд напряжений МИНВЕЛЛ - 48В.. Тут проблемы с понижением, большинство микросхем регуляторов работают до 42В.
Даже для получения +5В, нужен импульсник или резистивной балласт, т.к стабилизаторы серии 78хх работают до 35В. Кстати, с 27В я еще хочу получить отдельным пробразователем ещё и питание второй нагрузки: +12В 1.5А, Нагрузки одновременно не работают. Т.е с понижением с 48В до 12 и регулируемым выходом 2-36В я вижу больше проблем в стоимости изделия, чем при питании от 27В.

Не, тут проблемы не в микросхеме, надежды на чудо с двумя резисторами обвязки оставьте сразу..
Это делать придется как россыпь. Микросхема - только контроллер.
С 48 вольт несколько проще до 36, но на 2-3 вольтах ключ будет на одних фронтах работать. заполнение маленькое.
Впрочем, с 48 вольт можно попробовать и бакбуст и даже степдаун. Последнее - самое экономичное по моточным, но в случае пробоя ключа 48вольт попадет на движок. отается только надеяться на встроенные защиты Меанвелла.