Вообщем необходимо проверять не превышает ли зазор от пэда до маски расстояние до полигона и проводников. Можно ли это сделать стандартными правилами? или только скриптами? Правилами пока не получается..

Несовсем понятен вопрос! Отвечу на то что понял...
Никогда не заморачиваался на эту тему так как отступ маски от пада (0.05-0.1мм) заведомо меньше используемого "клиренса" (0.1-0.25...мм)

Это ясно, что обычно меньше, но просто попался элемент (из старых библиотек, когда зазоры были большие) с отступом по маске 0,2мм в плате с клиренсом 0,2мм. Интересно, можно ли автоматически проверять такие вещи.

Есть куча микросхем с 0,2мм зазорами между площадками... и ничего, паяют.