Никак вроде бы частота ШИМ не зависит от разрядности
Разрядности будет соответствовать минимальный шаг, с которым Вы сможете менять коэффицент заполнения. 16 бит будет означать, что нужно реализовать 2^16 различных значений коэффицента заполнения. Минимальная частота ШИМ будет в два раза больше верхней частоты полезного сигнала, т.е. примерно 40кГц. А вот минимальная длительность импульсов. то да, получается ~1/(4000*2^16) , если усилитель делаете, я бы расчитывал на минимальную длительность 50 нан, т.е. 500 различных значений(9 бит~) для 40 кГц.