Перед тем как покупать деталюшки и разводить плату, попробуйте в Quartuse сделать заготовку проекта. Т. е. например, принять и записать пару байтов в память. Прописать все основные входные и выходные сигналы. Но сначала их не привязывать к конкретным пинам. Пусть они раскидаются автоматом. Задать констрейны. Убедиться что вы получаете нужные вам частоты. Потом при разводке платы сможете проверять на какие выводы вы можете выводить нужные сигналы.