На самом деле размещать нужно не гор./верт. по сторонам, а как удобно для дальнейшей трассировки.
А дорожки ведутся по той стороне, которая выбрана внизу, это да. Правда интеллектуальная трассировка(Interactive Route или Advanced Route в 2006-м) сама определяет, на какой стороне находится площадка и начинает вести по той стороне. Но это справедливо для СМД площадок. Сквозные отверстия с площадками с обоих сторон будут трассироваться по текущему выбранному слою.